Кафедра Биологии почв

Раздел материалов кафедры Биологии почв.

Закончила МГУ факультет почвоведения кафедру биологии почв в 2007 году. Работала 3 года экологом, 1,5 года учила детей биологии в школе. Сейчас устроилась на работу своей мечты - научным сотрудником в лабораторию марикультуры беспозвоночных ФГБНУ "ВНИРО".

Лаборатория занимается воспроизводством беспозвоночных. Основные объекты: камчатский краб и гигантская пресноводная креветка. По сути приходится осваивать новую профессию, но знания полученные на кафедре очень пригождаются.

Для микробиолога в любой отрасли есть работа. Для большинства людей бактерии, грибы, дрожжи, актиномицеты - суть одно и тоже. Что-то маленькое, опасное и жутко не понятное. И с какой стороны подойти к проблемам, вызываемым микроорганизмами - трудный вопрос. А уж что их можно заставить работать на себя и вовсе странная мысль.

Как оказалось, 5 лет учебы не прошли для меня даром. Спасибо родному институту и всем преподавателям, что не смотря на все мои упорства сделали из меня человека, увлеченного окружающим миром и по настоящему счастливого.

Никонова Ирина

Юрков Андрей Михайлович -  куратор и заведующий лабораторией грибов и дрожжей в Немецкой Коллекции Микроорганизмов и Клеточных Культур: Leibniz-Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures. Основное направление исследований - экология и систематика грибов, а также методы и подходы к их идентификации.

Выпускник кафедры биологии почв, руководитель дипломной работы - И.П. Бабьева. Во время аспирантуры под руководством И.Ю. Чернова участвовал в международной научной школе по систематике и экологии дрожжей, van Uden international advanced course on molecular ecology, taxonomy and identification of yeasts, который проходил в Португалии в Universidade Nova de Lisboa.

После окончания аспирантуры и защиты диссертации работал научным сотрудником во Всероссийской Коллекции Промышленных Микроорганизмов (ВКПМ) под руководством М.М. Вустина. После этого недолго работал младшим научным сотрудником на Кафедре Биологии почв факультета Почвоведения МГУ. Работал научным сотрудником в Рурском Университете Бохум (Федеративная Республика Германия). После этого - научный сотрудник и куратор в Португальской Коллекции Дрожжей (PYCC), Universidade Nova de Lisboa. Руководитель и участник грантов и стажировок от научных фондов Российской Федерации, Федеративной Республики Германии и Португалии.

В настоящее время я работаю в DSMZ - одном из крупнейших биобанков микроорганизмов в Мире и в ведущем центре по систематике прокариот. Коллекция грибов в DSMZ динамически развивается и охватывает все крупные группы этого царства живых организмов. Коллекция пополняется через открытое депонирование и через собственные научные проекты, включая исследования почвенных дрожжей. Через свои работы я стараюсь продолжать и развивать научное направление (почвенная зимология), начатое в лаборатории Почвенных Дрожжей на кафедре Биологии Почв факультета Почвоведения МГУ.

Сазонов Сергей Николаевич - родился 27.09.1979, поступил на факультет Почвоведения МГУ им. М.В. Ломоносова в 1996 г. В 2001 году окончил кафедру Биологии почв. С 2001 по 2004 год – аспирант той же кафедры.

Защитил 22.02.2005 года кандидатскую диссертацию на тему: «Микробиологическая характеристика самовосстанавливающейся дерново-подзолистой почвы».

После окончания работал в Министерстве природных ресурсов Российской Федерации (Департамент государственной политики в сфере охраны окружающей среды), занимался вопросами нормативного обеспечения в сфере охраны окружающей среды (государственное регулирование по вопросам выбросов, сбросов загрязняющих веществ, размещения отходов и др.), а также в сфере нормативного регулирования государственной экологической экспертизы.

С 2007 года – ПАО «Газпром» (дочернее Общество ЗАО «Газпром инвест Юг», начальник отдела внутренних экспертиз. Сфера деятельности – экспертиза проектной документации объектов капитального строительства (в том числе на соответствие документации требованиям в сфере охраны окружающей среды), организация проведения государственной экспертизы, устранение замечаний к проектной документации, получение согласований и мн. др.

Выпускники кафедры Вечерский М.В. и Кузнецова Т.А. (а также примкнувший к ним Степаньков А.А.) образовали группу изучения микробных ассоциаций пищеварительных трактов животных в составе лаб. Экологии и функциональной морфологии высших позвоночных ИПЭЭ РАН. Ранее были сотрудниками группы Изучения азотфиксации проф. Умарова М.М. Продолжают активно работать с сотрудниками кафедры: Умаровым М.М., Костиной Н.В., Голиченковым М.В., выпустили более десятка совместных научных статей, выполнили четыре общих проекта РФФИ. Основные интересы группы связаны с микробной деградацией структурных углеводов в кишечнике фитофагов и обогащением кормовой массы биологическим азотом в результате азотфиксации и рециклизации мочевины. Несмотря на отсутствие пропуска в МГУ планируют углублять сотрудничество с кафедрой.

Группа планирует два основных направления сотрудничества:

  1. Изучение анаэробных функциональных группировок, включающих некультивируемые формы.
  2. Изучение микробиомов, ассоциированных с кишечником тропических беспозвоночных.

Одна из ключевых особенностей группы – работа с дикими животными. Это выгодно отличает ее от основной массы ученых,  изучающих модельных, сельскохозяйственных и домашних животных. Полученные данные на маралах, лосях, бобрах, тетеревах, глухарях, зайцах, сусликах, песчанках, полевках, пищухах и вальдшнепе позволили существенно расширить представления о роли кишечной микробной ферментации у диких животных.

 

Генетический почвовед стала вирусологом и многодетной мамой

Я – научная внучка Г.В. Добровольского. Я училась на кафедре биологии почв факультета Почвоведения МГУ в 1992-1998 годах, и защищала дипломную работу под руководством Татьяны Глебовны Добровольской. После окончания поступила в аспирантуру НИИ ЭЧ и ГОС им. Сысина, и защитила диссертацию по молекулярным методам идентификации вирусов человека в окружающей среде. Наш хлеб – вода, и вирусы в ней. Мы разрабатываем молекулярные методы выявления и учёта вирусов, и внедряем их на всех санэпидстанциях страны. Параллельно с работой я воспитываю шестерых будущих научных правнуков Г.В. Добровольского.

Дарья Лаврова, НИИ ЭЧ и ГОС им. Сысина – Научно исследовательский институт экологии человека и гигиены окружающей среды, научный сотрудник лаборатории санитарной микробиологии

Генетический почвовед стал генетиком и фотографом

Я учился на кафедре биологии почв факультета Почвоведения МГУ в 1992-1998 годах. После окончания поступил в аспирантуру ГосНИИ генетика, защитил диссертацию по генетике микроорганизмов, и работаю там по сей день. Мы с помощью генной инженерии создаём современные штаммы промышленных микроорганизмов, с помощью которых производится множество полезных веществ – от антибиотиков до компонентов пластмасс.

Параллельно с работой я фотографирую наших бактерий, раскрывая непосвящённым их микробиологическую красоту.

Константин Лавров, ГосНИИ генетика – Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов, научный сотрудник лаборатории Генетики биотрансформации

Закончила Кафедру биологии почв в 1998 г. Осталась в аспирантуре. В 2002 г. защитила диссертацию по взаимодействию хищных грибов и нематод.

С 2003 г. работаю во ВНИИП им. К.И. Скрябина.

В 2011 г. защитила докторскую диссертацию, посвященную биологической регуляции фитопаразитических нематод в почве. Кафедра биологии почв сыграла решающую роль в моей жизни - я встретила интересных, увлеченных своей работой людей. Получила знания, необходимые мне для научной работы, и просто человеческую поддержку.

Мигунова Варвара Дмитриевна, заведующая лабораторией фитогельминтологии ВНИИП им. К.И.Скрябина.

 

 

Закончила Кафедру биологии почв в 1998 г. Осталась в аспирантуре. В 2002 г. защитила диссертацию по взаимодействию хищных грибов и нематод.

С 2003 г. работаю во ВНИИП им. К.И. Скрябина.

В 2011 г. защитила докторскую диссертацию, посвященную биологической регуляции фитопаразитических нематод в почве. Кафедра биологии почв сыграла решающую роль в моей жизни - я встретила интересных, увлеченных своей работой людей. Получила знания, необходимые мне для научной работы, и просто человеческую поддержку.

Мигунова Варвара Дмитриевна, заведующая лабораторией фитогельминтологии ВНИИП им. К.И.Скрябина.

 

Терехов Алексей - кандидат биологических наук. Закончил МГУ в 1998 г. Защитил диссертацию "Экологические ниши почвенных актиномицетов" в 2003 г. Работал в различных лабораториях микробиологического профиля Российской Академии наук и в Государственном научном центре антибиотиков.

Имею более 20 публикаций и 2 патента на изобретения в области микробиологии. В настоящее время работаю экологом-изыскателем, осуществляю комплексные инженерно-экологические изыскания, в которых требуется использовать фундаментальные энциклопедические знания о природе в сочетании с умением вести прикладные исследования, оперативно решать проблемы при выполнении полевых работ, умением видеть природу одновременно глазами натуралиста-эколога и инженера-проектировщика, чтобы минимизировать ущерб природе и возможные экологические риски хозяйственной деятельности при реализации различных проектов. МГУ стал для меня за время учебы родным домом. Особую благодарность я храню всем сотрудникам кафедры, особенно научным руководителям д.б.н. П.А. Кожевину и профессору д.б.н. Г.М. Зеновой. Во многом всё то, что я знаю и умею - дал мне Университет.

Кулько Александр Борисович специализируется в области лабораторной диагностики аспергиллеза, кандидоза и других бронхолегочных микозов; является автором более 70 научных публикаций по различным аспектам медицинской микологии, в том числе методических рекомендаций Департамента здравоохранения правительства Москвы. В 2012 г. А.Б. Кулько опубликовал иллюстрированный «Атлас условно-патогенных грибов рода Aspergillus – возбудителей бронхолегочных инфекций», включающий описания 14 видов клинически значимых грибов рода Aspergillus, способных вызывать поражения бронхов и легких.

Полученные мною на кафедре «Биологии почв» (научный руководитель – академик РАЕН, профессор О.Е. Марфенина) фундаментальные знания по морфологии, физиологии и экологии микроскопических грибов, актиномицетов и других групп бактерий нашли свое применение в прикладной области медицинской микологии.

Кулько Александр Борисович, ведущий научный сотрудник отдела проблем лабораторной диагностики туберкулеза и патоморфологии «Московского городского научно-практического центра борьбы с туберкулезом Департамента здравоохранения города Москвы»

Злотников Артур Кириллович - выпускник кафедры биологии почв 1995 года. В 1998 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Ризосферная азотфиксирующая ассоциация Bacillus firmus и Klebsiella terrigena и ее влияние на яровой ячмень при инокуляции».  В 2011 году защитил докторскую диссертацию на тему «Разработка и комплексная характеристика полифункционального препарата Альбит для защиты растений от болезней и стрессов».

В настоящее время является одним из руководителей ООО НПФ «Альбит», деятельность которой посвящена выпуску биотехнологической продукции – антидота Альбит для защиты сельскохозяйственных растений от фитотоксического действия пестицидов. Альбит разрешён к использованию в органическом земледелии Швейцарии и Евросоюза. Альбит ‑ одна из немногих разработок отечественных учёных, на равных конкурирующая с аналогами не только в России, но и за рубежом. Альбит успешно применяется сельхозпроизводителями от Германии и Швейцарии до Приморья и Китая, от Финляндии и Вологодской области до Краснодарского края и Нигерии. 

Передо мной никогда не стоял вопрос выбора профессии. Еще со школы я интересовалась биологией. Но, только поступив на кафедру биологии почв факультета Почвоведения МГУ им. М.В. Ломоносова, я открыла для себя удивительный мир микроорганизмов, населяющих нашу планету.    

Учеба на факультете для меня это: ребята-однокурсники, со многими из которых мы до сих пор поддерживаем тесные связи; это строгие, но справедли­вые, отзывчивые и добрые, а главное высококвалифицированные преподаватели; это познавательные лекции и полезные практические занятия и потрясающе интересная наука – микробиология.

Курсовые и дипломная работа, учеба в аспирантуре и защита диссерта­ции, под руководством проф. Д.Г. Звягинцева, проф. Г.М. Зеновой и д.б.н. П.А. Кожевина – это тот багаж знаний и опыта, которые, безусловно, помогли мне в выборе дальнейшего пути – моей работе в Институте микробио­логии Российской академии наук. Освоенные на кафедре методы микробиологии и теоретическая база оказались незаменимы в изучении микробного мира, поиске новых организмов и изучении уже известных. В нашем институте работает много выпускников кафедры биологии почв МГУ. Результаты их работы, статьи в известных научных журналах говорят о высокой профессиональной подготовке, полученной в университетских стенах.

И, хотя я уже давно окончила Университет, у меня до сих пор самые близкие, деловые и просто человеческие отношения с сотрудниками моей родной кафедры. Хочется искренне сказать: огромное спасибо ВАМ за всё, что ВЫ делали и делаете для студентов и аспирантов, для бывших и нынешних своих учеников, для развития микробиологии как фундаментальной и прикладной науки. Здоровья ВАМ и больших научных достижений!

Что еще можно добавить? Что университет действительно стал для меня вторым домом, что он дал мне заряд на всю жизнь, обогатил знаниями и желанием познавать новое. И это не просто высокие слова. Надеюсь, что нынешние студенты поймут меня, когда будут вспоминать свои университетские годы с чувством бесконечной радости и благодарности. 

Ваша Тамара Бабич

Вышло учебное пособие доцента кафедры биологии почв, доктора биологических наук Н.А.Манучаровой.

Манучарова Н.А. Молекулярно-биологические методы в почвоведении и экологии : учебное пособие. - М: "Университетская книга", 2014. - 68 с. (ISBN 978-5-91304-341-2)

В пособии изложены принципы и методические аспекты применения молекулярных методов для исследования биологических объектов природных экосистем. Обсуждаются вопросы определения биоразнообразия микробного прокариотного комплекса, находящегося в метаболически активном состоянии в исследуемых системах.
 
Для студентов, аспирантов, преподавателей и научных работников, специализирующихся в области почвенной микробиологии, агрохимии, почвоведении, экологии.
 
Издано при финансовой поддержке гранта РФФИ № 13-04-00269.

 

Manucharova N.A. ECOPHYSIOLOGY OF HYDROLYTICAL MICROBIAL COMMUNITIES IN TERRESTRIAL ECOSYSTEMS : Study guide. – М. Publishing company “University book”, 2014. – p.71

Application of molecular biological techniques (FISH) in environmental studies provides a more complete information concerning the taxonomic diversity and potential hydrolytic activity of microbial complexes of terrestrial ecosystems that exist in a wide range of environmental factors (moisture, temperature, redox potential, organic matter). The combination of two molecular biological techniques (FISH and DGGE-analysis of fragments of gene 16S rRNA total amplificate) enables an informative assessment of the differences in the structure of dominant and minor components of hydrolytic complexes formed in different tiers of terrestrial ecosystems. The functional activity of hydrolytic microbial complexes of terrestrial ecosystems is determined by the activity of dominant and minor components, which also have a high gross enzymatic activity. Degradation of  biopolymers in the phylloplane is mainly due to the representatives of the Proteobacteria phylogenetic group (classes alpha and beta). In mineral soil horizons, the role of hydrolytic representatives of Firmicutes and Actinobacteria increases. Among the key environmental parameters that determine the functional activity of the hydrolytic (chitinolytic) complex of soil layer (moisture, nutrient supply, successional time), the most significant one is moisture. Moisture levels providing maximum activity of a hydrolytic microbial complex depend on the soil type. Development of a hydrolytic microbial complex occurs in a very wide moisture range - from values close to field capacity to those close to the wilting moisture point. The functional role of mycelial actinobacteria in the metabolism of chitin consists, on the one hand, in active decomposition of this biopolymer, and on the other hand, in the regulation of microbial hydrolytic complex activity through the production of biologically active regulatory metabolites, which occurs in a wide range of environmental parameters (moisture, temperature, organic matter, successional time). Experimental design is applicable to identify in situ optimal values of environmental factors that considerably affect the functional parameters of hydrolytic microbial complexes. 
Recommended Training Council in soil science at EMA classical universities of Russia as a textbook for students of higher educational institutions, students in the direction of "soil science" – 0219000.

 

Вышла монография доцента кафедры биологии почв, доктора биологических наук Н.А. Манучаровой.

Манучарова Н.А. Гидролитические прокариотные комплексы наземных экосистем. - М: "Университетская книга", 2014. - 272 с. (ISBN 978-5-91304-342-9)

Монография посвящена исследованию специфики устойчивости и развития гидролитических прокариотных комплексов, осуществляющих деструкцию полисахаридов (хитина и пектина) в наземных экосистемах, установлению закономерности их распространения в биогеоценозах и  зависимости функциональной активности от основных экологических факторов (влажности, температуры, присутствия метаболизируемого субстрата). На основе экофизиологических критериев определена  функциональная значимость гидролитических прокариотных микробных комплексов в наземных экосистемах, выявлена степень  толерантности исследуемых микробных комплексов  к экстремальным параметрам экологических факторов. Разработана модификация флюоресцентномикроскопического метода анализа гибридизации клеток in situ (FISH) для определения филогенетического положения метаболически активных гидролитических прокариот вертикальных ярусов наземных экосистем – почвенного, наземного (подстилка) и надземного (филлосфера). Обнаружена новая функциональная активность актиномицетов в гидролитическом прокариотном комплексе: их контролирующее влияние на уровень дыхания комплекса в широком диапазоне параметров (влажности, поступления органического вещества, сукцессионного времени). Установлена возможность классификации и биодиагностики образцов наземных экосистем по структурному показателю микробного комплекса, в том числе по его гидролитической составляющей.

Книга предназначена для специалистов микробиологов, экологов, почвоведов, агрохимиков и биотехнологов, может служить учебным пособием для студентов, обучающихся по данным специальностям.

Вышла монография заведующего кафедрой биологии почв, член-корр. РАН, проф. И.Ю. Чернова.

Чернов И.Ю. Дрожжи в природе. - М: Товарищество научных изданий КМК, 2013. - 336 с. (ISBN 978-5-87317-927-5)

В монографии обобщены знания об особенностях экологии дрожжевых грибов. При этом автор ставил перед собой две задачи. Во-первых, представить общую картину распространения дрожжевых грибов в природе на основе собственных материалов, полученных за более чем 30-летний период исследований, и всех имеющихся данных, относящихся к этому вопросу. Во-вторых, попытаться на примере дрожжевых грибов, как на удобной модельной группе микроорганизмов, обсудить ряд дискуссионных проблем, таких как природа вида у агамных организмов, количественная оценка разнообразия и его форм, экологическая целостность высших таксонов, дискретность и континуальность микробных сообществ, подходы к их классификации. Книга предназначена для микробиологов, микологов, экологов, почвоведов, а также студентов данных специальностей.

 
 

 
 
 
Спонсор конференции: