Инструменты интеграции в геном Escherichia coli и других представителей порядка Enterobacteriales

Защита состоится 12 декабря 2023 года в 15:30 в совете МГУ.015.2 МГУ имени М.В. Ломоносова, биолого-почвенный корпус, ауд. М-1

Кандидатская диссертация по специальностям 1.5.11 - Микробиология, 1.5.6 - Биотехнология (биол. науки)

Соискатель: Бубнов Д.М., МГУ имени М.В. Ломоносова

Научный руководитель: Нетрусов А.И., д.б.н., проф., Институт нефтехимического синтеза им. А.В. Топчиева Российской академии наук, МГУ имени М.В. Ломоносова

Организация, в которой выполнялась работа: МГУ имени М.В. Ломоносова

Оппоненты: Манухов И.В., Дорошенко В.Г., Калебина Т.С.

Аннотация:

Диссертационная работа Бубнова Дмитрия Михайловича «Инструменты интеграции в геном Escherichia coli и других представителей порядка Enterobacteriales» посвящена проблеме интеграции синтетических последовательностей в геном микроорганизмов. Автором была создана стратегия селекции на основе репрессора транскрипции CI бактериофага λ и токсина Hok. Показано, что cI-hok превосходит все описанные в литературе маркеры негативной селекции, а его эффективность достигает предельно возможных значений. Показана возможность увеличения частоты интеграции неметилированных линейных конструкций в бактериальный геном в результате экспрессии ocr бактериофага T7. Показана возможность интеграции в произвольные локусы хромосомы синтетических конструкций длиной до 8 т.п.н. с помощью негативной селекции cI-hok и Ocr-опосредованной Red-рекомбинации. Показана эффективность этого подхода в работе с четырьмя микроорганизмами, принадлежащими к порядку Enterobacteriales.